Pandory Toolbox i innych mediów

Link: http://cengique.duckdns.org/~cengiz/pandora/

PANDORA Toolbox

PANDORA to Matlab Toolbox sprawia, że ​​zarządzanie bazą danych dostępną z projektu elektrofizjologicznym.

PANDORA działa poprzez ekstrakcję cech zdefiniowanych przez użytkownika z surowych danych nerwowych (np ślady napięcia) oraz tworzenie numerycznych tabele bazy danych od nich. Tabele te mogą być następnie poddany dalszej analizy, takimi jak działanie na niezmienna statystycznej korelacji i głównych elementów. Działki publikacja gotowych może być wytwarzany z wbudowanym systemem kreślenia.

Cechy:

Sprawia, zarządzania bazami danych dostępne z projektu elektrofizjologicznym;
Działa w trybie offline ciągu Matlab;
Nie wymaga dodatkowego oprogramowania;
Jest zorientowany obiektowo i umożliwia łatwe rozszerzenia;
Można łatwo powiązać z istniejącymi skryptami Matlab;
Czy zapytanie do bazy danych, jak w SQL.
Wymagania:

Podstawowa instalacja Matlab dla natywnego wsparcia bazy danych.
Opcjonalnie: Matlab Database Toolbox do importu / eksportu z / do zewnętrznego serwera SQL.
Opcjonalnie: PANDORA automatycznie skorzysta z lepszych funkcji filtrowania czy Matlab Signal Processing Toolbox jest dostępny.
Koncesjonowanie:

PANDORA może swobodnie korzystać z licencji Academic bezpłatnym 3.0, ale należy przytoczyć następujący papier z oprogramowaniem lub publikacji:
Günay C, Edgerton JR Li S, Sangrey T, Prinz AA, Jaeger D (2009). Analiza bazy danych symulowanych i zapisanych zestawów danych elektrofizjologicznych z przybornika Pandory. Neuroinformatyka, 7 (2): 93-111. doi: 10.1007 / s12021-009-9048-Z.
Dokumentacja:

Użyj Matlab Pomoc, aby uzyskać dostęp do najbardziej dokumentację up-to-date na PANDORA.
Projekt i wiki stron przy Software Center incf.
Dwa dokumenty z materiałów i przykładów uzupełniających.
Dokumentacja HTML (przeglądać online, pobierz) (wiek!)
Dokumentacja w formacie PDF (stary!)
Pomoc

Omów swoje pytania na parametr wyszukiwania Google Group.
Albo wysłać zapytanie prywatnym> cgunay z Emory dot edu cgunay z Emory dot edu <.

Jeśli zaczniesz używać CGMPLOT, zarejestruj się ze mną wysyłając mi krótki e-mail z nazwą i ubezpieczenia tak, że mogę dostarczyć modernizacji i poprawkowe informacji w przyszłości. Dzięki!

Narzędzie Gencompress

Gencompress może kompresować pliki binarne z symulatora nerwowej Genesis ze średnich kursów sprężania 10: 1 *.
Natomiast kompresji bezstratnej dane są początkowo obcinane do rozdzielczości 16 bitów. Kodek dźwięku bezstratnego FLAC jest dostosowany do realizacji tego działania.

* W wewnątrzkomórkowych śladów jednokanałowym napięcia. Może się wahać z innymi wejściami.

Pobieranie:

Stabilna wersja:
Pakiety binarne dla architektury i686 i x86_64 platform Linux.
Pakiet źródłowy dla wszystkich innych architektur i platform.
Testowanie wersji, które mogą obsługiwać pliki> z> 2GB i 32767 kanałów:
Pakiet źródłowy dla wszystkich architektur i platform.
powiązane projekty

Znalezisko Matlab Toolbox jest analiza zestaw narzędzi open source do nagrywania wielu neuronów i symulacji sieci. ZNAJDŹ stojaki do wyszukiwania informacji w Neural danymi.

Zawiera:
Szeroki wybór akwizycji i formatów wejściowych symulator oparty na Neuroshare Project.
Spike wykrywania i sortowania z nagrań zewnątrzkomórkowej.
NeuroTools to zestaw narzędzi napisanych w Pythonie do zarządzania, przechowywania i analizy obliczeniowe symulacje Neuroscience, opracowane w ramach inicjatywy parasol NeuralEnsemble.

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *